Kakeru, een voormalige eliterenner op de middelbare school, wordt achtervolgd omdat hij voedsel heeft gestolen. Hij wordt gered door Kansei University-student Haiji, die ook hardloper is. Haiji haalt Kakeru over om in het oude appartement 'Chikuseisou' te gaan wonen, waar hij van plan is samen te werken met medebewoners om deel te nemen aan de Hakone Ekiden Marathon, een van de meest prominente universiteitsraces in Japan. Kakeru komt er al snel achter dat alle bewoners, behalve Haiji en hijzelf, complete beginners zijn.

Mizuki Hijiri is een middelbare scholiere die net van school is overgestapt. Op haar nieuwe school heeft ze een noodlottige ontmoeting met jongens die lijden aan chuunibyou (grootheidswaanzin bij adolescenten). Er is Noda die ervan droomt een held te worden, de tragisch knappe otaku Takashima die alleen van 2D-meisjes houdt, Nakamura de zogenaamd 'gereïncarneerde' engel of duivel (hij kan niet beslissen welke), en de zelfbenoemde touwtrekker Tsukumo.

Geïnspireerd door een kleine professionele volleyballer, creëert Shouyou Hinata een volleybalteam in zijn laatste jaar op de middelbare school. Helaas moet het team het opnemen tegen het team van 'King of the Court' Tobio Kageyama in hun eerste toernooi en onvermijdelijk verliezen. Na de verpletterende nederlaag zweert Hinata Kageyama te overtreffen. Nadat ze naar de middelbare school is gegaan, voegt Hinata zich bij het volleybalteam, maar ontdekt dat Tobio er ook bij is.