Ash gaat verder met zijn opdracht om 's werelds grootste Pokémon trainer te worden, samen met zijn beste vriend Pikachu. Tijdens hun reis vinden ze het ei van Manaphy, en zijn beschermer, Pokémon Ranger Jack "Jackie" Walker. Jackie's missie is om het ei te beschermen voor de Phantom Pirate. Ash en zijn vrienden helpen hem daarbij, en proberen het ei terug te brengen naar de Sea Temple.

Nadat haar dorp is verwoest en alle inwoners zijn afgeslacht door de boze tovenaar Gardein en zijn meester The Dark Lord, zweert een krijger die bekend staat als Lemnear, The Silver Champion, hen beiden te vinden en te doden om het bloedbad te wreken.

Golgo 13, de meest gevierde en beruchte huurmoordenaar van Japan, ontmoet zijn gelijke in Queen Bee, de leider van een Zuid-Amerikaans bevrijdingsleger, die hij moet vermoorden voordat zij een populaire presidentskandidaat kan vermoorden. Zodra Golgo 13 echter de bijenkorf van de koningin binnendringt, realiseert hij zich dat de machinaties achter de geplande moord complexer zijn dan hij zich had kunnen voorstellen.

In 2100 fungeert de nieuw gebouwde Bayside City als de belangrijkste internationale haven van Japan. De Angel Arms Company is opgericht door een voormalige politieagente genaamd Takako, om met gewapende veiligheidspakken de strijd tegen het terrorisme te helpen voeren. Wanneer de burgemeester wordt vermoord, beschermen de vrouwen van Angel Arms uiteindelijk de kwaadaardige misdaadheer Hassan, in de hoop dat zijn informatie zal helpen een wereldwijde terreurring neer te halen. Takako staat met de rug tegen de muur als een bende criminelen plannen maakt om Hassan te vermoorden, en de leider van de organisatie blijkt de voormalige minnaar te zijn van Angel Arms 'eigen Alisa.