Een complex en schokkend verhaal geïnspireerd door hedendaagse sekten in Israël en de rest van de wereld. Harem vertelt het verhaal van een charismatische mystieke genezer en sekteleider, Shabtai, die in Tel Aviv woont met 20 vrouwen en meer dan 40 kinderen. Shabtai heeft de autoriteiten ontweken door zijn enorme familie twintig jaar lang te isoleren van de samenleving.

Akiva en Shulem Shtisel, vader en zoon, zitten op een klein balkon met uitzicht op de straten van de Geula-wijk van Jeruzalem. Een jaar is verstreken sinds de moeder stierf. Alle andere kinderen hebben het nest verlaten en alleen Shulam en Akiva blijven over. Ze maken ruzie en maken het weer goed en lachen om zichzelf en de rest van de wereld. Alles zal veranderen wanneer Akiva Elisheva ontmoet.

Esther Shapiro is een jonge vrouw die is opgegroeid in een ultra-orthodoxe gemeenschap in de wijk Williamsburg in Brooklyn. Op een dag besluit ze haar hechte geloofsgemeenschap en haar gearrangeerde huwelijk achter te laten. Esther wil muzikant worden en reist af naar Berlijn om haar droom te realiseren. Ze wordt echter achtervolgd door haar verleden.

Vier rechercheurs in vier verschillende tijdperken vinden het lichaam van hetzelfde moordslachtoffer in het Londense Whitechapel. Edmon Hillinghead is in 1890 de meest ijverige rechercheur van de stad terwijl Jack the Ripper door de straten sluipt. In 1941 regeert Charles Whiteman over de straten door de oplichterspraktijken te leiden die hij hoort op te doeken. Shahara Hasan voert een strijd met racistische relschoppers in 2023 en in het jaar 2053 kampt de jong Maplewood met geheugenverlies als een van de laatste overlevenden van een aangstaanjagende techno-apocalyps. Tijdens hun onderzoek ontdekt het viertal dat ze te maken hebben met een mysterieuze samenzwering die meer dan 150 jaar omvat.