Death Note: Schrijf de naam van degene die gestraft moet worden in dit schrift, haal zijn gezicht voor ogen en hij sterft binnen de veertig seconden aan een hartaanval. In deel twee bedenkt Light een riskante onderneming; hij sluit zich aan bij het speciale onderzoeksteam dat op zoek is naar hem en zijn Death Note. Hij hoopt zo de verdenking van zich af te wenden en de ware identiteit van superdetectieve L. te achterhalen. Wanneer Rem, een nieuwe doodsgod, op aarde neerstrijkt met een tweede schrift, krijgt Misa het in handen.Dit tweede schrift stelt de eigenaar in staat om de ware identiteit van mensen te achterhalen. Het duurt niet lang of Light en Misa slaan de handen ineen om samen L.'s ware identiteit te achterhalen, zodat ze zijn echte naam in het schrift kunnen schrijven. Maar L. heeft nog een troef in handen... De laatste naam die in de Death Note geschreven wordt... van wie zal die zijn?

Op een dag vindt Yagami Light een notitieboek waarop "Death Note" staat. Light vindt al snel uit dat het boekje de kracht heeft om mensen te vermoorden, wiens naam erin staan. Hij besluit om het boek te gebruiken in de naam van het goede.

Tien jaar na de confrontatie tussen Kira en L, stuurt Shinigami “Death Notes” waardoor de wereld in chaos verkeert. Tsukuru, een lid van de 'Death Note special task force', verenigt zich met 6 detectives, waaronder Matsuda die eerder het geval van Kira onder handen nam. Door het notitieboek vinden er massamoorden plaats. De detectives ontdekken het bestaan van zes verschillende “Death Notes”. Het computervirus Kira verspreidt zich over de wereld en de confrontatie begint tussen diegenen die Kira willen doen heropleven en de mensen die het willen tegengaan.