In Het geheim van het Verloren Rijk wordt Bloom, samen met de Winx, geconfronteerd met de ultieme uitdaging: in de diepste en donkerste dimensie moet ze strijden tegen het Absolute Kwaad om verenigd te worden met haar ouders van wie ze als baby werd gescheiden. De Winx hebben hun machtige Enchantix-status bereikt en zijn echte beschermfeeën geworden om de bevolking van hun dimensies vrede en veiligheid te kunnen garanderen. Alleen Bloom heeft deze status nog niet bereikt omdat alle mensen van haar dimensie, Domino, zijn verdwenen. Bloom moet haar status zien te ontvangen door haar ouders te vinden en te redden. Dit lijkt een onmogelijke opgave.

De feestelijkheden op Alfea, de beste school voor feeën, zijn nog maar net begonnen als de boosaardige Trix, bestaande uit de heksenzusjes Icy, Darcy en Stormy, roet in het eten gooit. Zonder de stoere Bloom, de oprichtster van de Winx Club, moeten de Winx Stella, Flora, Layla, Tecna en Musa met lede ogen aanzien hoe het trio niet alleen hun feest verknalt maar ook nog eens een belangrijk geheimzinnig voorwerp steelt. Bloom geniet intussen in het Koninkrijk Domino, waar ze eindelijk met haar ouders herenigd is, met volle teugen van haar nieuwe leven als prinses. Ze is enorm opgewonden omdat Sky, de ware erfgenaam van het Eraklyon Koninkrijk, haar ten huwelijk heeft gevraagd. Alles lijkt idillisch, maar donkere wolken pakken zich samen. Een duister geheim bedreigt het magische evenwicht in het land. Het is nu aan Sky om het geheim te ontdekken. Hebben de heksen er iets mee te maken?

Een groep heel bijzondere jongens, onder leiding van de wijze Giamus en de pompoensmurf, proberen de Twinfire Brazier te bereiken voordat deze op is, precies zoals Meganò zou willen. Tijdens deze race tegen de klok ontmoeten ze zeer snelle dieren met wie ze bevriend raken en van wie ze nooit gescheiden zullen worden: zij zijn de Smile and Go! De verbintenis en vriendschap tussen Smile en Go is de enige kracht die in staat is om de energie van HeartHeat te ontketenen. Helaas zijn sommige Smile en Go echter bezweken voor Meganò's beloften van macht en kozen ze de kant van hem in de missie om het land achter het meer te veroveren.