'13 Flowers of Nanjing' is gesitueerd in 1937 in Nanjing in China tijdens de Sino-Japanse oorlog. Een stel dappere vluchtingen wordt opgevangen in een kerk. De groep, samengekomen door de verschrikkelijke chaos van de oorlog, riskeert hun leven voor de schoolkinderen van de kerk tijdens de gewelddadige invasie van de stad.

Een tiener, die dol op gamen is, wordt op magische wijze naar het verre China getransporteerd. Hij komt daar voor een bijzondere uitdaging te staan. De jongen kan een echte prinses redden. Maar dan moet hij wel al zijn game-ervaring gebruiken om een ware Kungfu-krijger te worden.

Sun Wukong verveelt zich op aarde, waar niemand hem de baas kan. Daarom trekt hij naar The Heavenly Kingdom, waar hij meteen van zich laat horen. Maar hij onderschat de kracht van de inwoners en krijgt een kroon op die zijn krachten beperkt. Hij wordt verbannen uit het rijk, maar zweert wraak te nemen.

Tijdens een periode van onrust wordt de wereld geconfronteerd met een grote dreiging. Er zijn namelijk demonen die op vernietiging uit zijn. Om het gevaar het hoofd te bieden vormen helden binnen de vechtkunst een geheime organisatie.