Johnny Smith ontdekt dat hij na een coma paranormale gaven heeft ontwikkeld.

Het verhaal van Stargate SG-1 begint ongeveer een jaar na de gebeurtenissen in de speelfilm, wanneer de regering van de Verenigde Staten ontdekt dat een oud buitenaards apparaat, de Stargate genaamd, toegang heeft tot een netwerk van dergelijke apparaten op een groot aantal planeten. SG-1 is een elite speciaal operatieteam van de luchtmacht, een van de meer dan twee dozijn teams van de aarde die de melkweg verkennen en zich verdedigen tegen buitenaardse bedreigingen zoals de Goa'uld, Replicators en de Ori.