Barney Thomson is een wat vreemde en bedeesde kapper uit Glasgow. Hij leidt een zeer middelmatig en oninteressant leven samen met zijn vrouw en moeder, tot hij de groteske en absurde wereld van een gestoorde seriemoordenaar binnentreedt...

De familie van een jonge volwassen vrouw (Agyness Deyn) wordt getroffen door een tragedie in het Schotland van voor de Eerste Wereldoorlog. De grote sociale onrust van die tijd zorgt ervoor dat de ergste aspecten van de moderne wereld het afgelegen landelijk gebied bereiken.

De inwoners van het geïsoleerd Schotse eiland Todday krijgen weinig mee van de rantsoenering door de oorlog, totdat er geen whisky meer geleverd wordt op het eiland. Het leven op het eiland gaat door, maar zonder hun geliefde drank.

In 1926 arriveert Newt Scamander bij het Magische Congres van de Verenigde Staten met een magische koffer die een aantal gevaarlijke wezens en hun leefomgeving bevat. Wanneer de wezens ontsnappen gaan de Amerikaanse Magische Authoriteiten tot vervolging van Newt over.

De film vertelt het verhaal van de evacuatie van geallieerde troepen uit Duinkerken in 1940. Tijdens de Slag om Frankrijk werden Belgische, Britse en Franse soldaten door het Duitse leger vastgehouden op het strand en in de haven.

De tachtigjarige Edith Moore is een bittere, eigenwijze Engelse dame. Na de dood van haar dominante man George en door de steeds slechter wordende relatie met haar dochter, besluit ze haar jeugddroom na te jagen. Ze vertrekt halsoverkop naar de Schotse Hooglanden om daar een berg te beklimmen. Onderweg ontmoet ze Jonny, een jonge man die haar helpt met het aanschaffen van de juiste uitrusting en die haar traint om de berg te kunnen beklimmen. Ze kletsen, ruziën, maken lol en onthullen steeds meer over hun leven aan elkaar.

In 1927, enkele maanden na de gebeurtenissen uit de eerste film, is Gellert Grindelwald ontsnapt en is hij medestanders naar zijn kant aan het overhalen. Dit met de belofte om tovenaars te verheffen boven alle niet-magische wezens.