Wanneer een succesvolle Japanse zakenman dood wordt geacht na zijn ontvoering door piraten, start hij een nieuw leven als piraat tussen zijn ontvoerders.

Kenzou Tenma, een Japanse hersenchirurg in Duitsland, komt in grote beroering nadat hij betrokken raakt bij een psychopaat die ooit een voormalige patiënt was.

In Kino's Journey reist de hoofdpersoon, Kino, vergezeld van een pratende motorfiets genaamd Hermes, door een mystieke wereld van veel verschillende landen en bossen, elk uniek in zijn gebruiken en mensen. Ze brengt zonder uitzondering slechts drie dagen en twee nachten door in elke stad, vanuit het principe dat drie dagen genoeg tijd is om bijna alles wat belangrijk is over een plaats te leren, terwijl er tijd overblijft om nieuwe landen te verkennen.