FBI is een serie over de interne werking van het New Yorkse kantoor van de FBI, waarbij alle vaardigheden, intellect en de meest geavanceerde technologie van het Bureau worden gebruikt om New York en het land veilig te houden. Dit wordt onder anderen gedaan door speciaal agent Maggie Bell, een veteraan van het kantoor in Manhattan, en haar partner Omar Adom "OA" Zidan, die pas in dienst is en uit Queens, New York, komt. Hij werkte voorheen undercover voor de drugsafdeling. Assistent-speciaal agent Jubal Valentine leidt de onderzoeken vanuit het hightech kantoor in Manhattan, samen met analist Kristen Chazal.

De familie Roy, bestaande uit vader Logan (Brian Cox) en zijn vier kinderen, beheert een van de grootste media- en entertainmentbedrijven ter wereld: Waystar Royco. Als 80-jarige begint vader Logan fouten te maken. De mediamagnaat zal plaats moeten maken voor een opvolger. Maar wie? En ziet hij dat zelf ook zo?

Will Cooper is een alleenstaande ouder die zich volledig heeft toegelegd op het grootbrengen van zijn dochter Sophie. Hoewel dit zeer nobel lijkt, is Will zichzelf echter volledig vergeten. Zijn leven bestaat enkel nog uit feestjes, ouderavonden, de ouderraad en opvoeden. Wanneer andere alleenstaande ouders, Angie, Douglas, Poppy en Jake, in de gaten krijgen hoe ver Will van zijn eigen persoonlijkheid komt af te staan, besluiten ze in te grijpen. Samen proberen ze een mooie balans tussen een privéleven en hun levens als ouders te creëren.