Na een vliegtuigcrash stranden 25 schoolkinderen en een zwaargewonde piloot op een onbewoond eiland. Een van hen, Ralph, wordt als leider gekozen. Samen met de brave maar wat vadsige Piggy probeert hij hun leven op het eiland enigszins te organiseren. Er wordt ook afgesproken dat ze op het hoogste punt van het eiland een vuur zullen maken dat dag en nacht moet blijven branden. Al snel blijkt echter dat een groep jongens, onder leiding van de ambitieuze Jack, de ernst van de zaak niet wil inzien. Ze spelen liever dan vis te vangen en jagen liever dan dat ze het vuur aanhouden. Net op het ogenblik dat ze het vuur hebben laten uitgaan, vliegt er een helikopter over.

De drie Ninja's storten zich in een nieuw avontuur dat begint in een pizzeria waar Jo, een indianenmeisje, wordt lastiggevallen. Jack HArding heeft Jo's vader ontvoerd om de leden van de indianenstam stil te krijgen, die tegen het storten van illegaal chemisch afval op hun land protesteren. Maar de Ninja's moeten daar een stokje voor steken.

Een jonge en onervaren politieagent wordt overgeplaatst van een buitenwijk naar een bureau in de binnenstad van Philadelphia. Hier moet hij een team vormen met een pessimistische en door de straat geharde eenling. Samen moeten zij een netwerk van autodieven zien op te rollen.