Met de hulp van zijn trouwe beschermer Butler, zoekt de 12-jarige genie Artemis Fowl, afstammeling van een lange reeks criminele meesterbreinen, zijn mysterieus verdwenen vader en ontdekt daarmee een oude, ondergrondse beschaving - de verbazingwekkend geavanceerde wereld van feeën. Afleidend dat de verdwijning van zijn vader op de een of andere manier verbonden is met de geheimzinnige, teruggetrokken sprookjeswereld, verzint sluw Artemis een gevaarlijk plan - zo gevaarlijk dat hij uiteindelijk in een gevaarlijke oorlog van verstand terechtkomt met de almachtige feeën.