Yukito Kunisaki is op zoek naar een meisje met vleugels, die voorkomt in een verhaal uit zijn jeugd. Tijdens deze reis vestigt hij zich kort in een dorp. In dit dorp ontmoet hij een vreemde dame genaamd Misuzu. Hij raakt bevriend met haar en besluit te blijven in het dorp. Maar zijn zoektocht naar het meisje met vleugels blijft hij voortzetten.

De film transporteert de Precure naar een wereld in een prentenboek, waar ze worden begeleid door Niko, een mysterieuze bewoner van de prentenboekenwereld.

Het avontuur begint met het verschijnen van Mewtwo, een genetisch gemanipuleerde Pokémon, gecreëerd uit het DNA van Mew, de zeldzaamste van alle Pokémon. Mewtwo is vastbesloten om zijn superioriteit te bewijzen en verleidt Ash, Pikachu en de anderen in een strijd, zoals er nog nooit is geweest: Mewtwo tegen Mew, superkloon tegen Pokémon. Het gaat hier om de ultieme confrontatie met de toekomst van de wereld als inzet.

Deze aflevering speelt zich af voordat Mewtwo Ash en zijn vrienden ontmoet in Genesect and the Rise of Legend. De ongelooflijke snelheid en vechtvaardigheid van Mega Mewtwo Y worden voor het eerst onthuld, maar niet de echte naam. Hij beschikt over ongelooflijke kracht en wil de paden van mensen en Pokémon niet kruisen.

De eerste film van een vier-delige finale van Tamayura.

De tweede film van een vier-delige finale van Tamayura.

Kitarou, een geest, brengt zijn leven in het hiernamaals door met het helpen van mensen die zijn vaardigheden nodig hebben. Hij dwarsboomt de plannen van boze geesten die leven om de mensheid te kwellen. In deze aflevering kaapten de westerse demonen de Phantom Train. Kitaro en zijn vrienden moeten deze misdaad stoppen.

Ash gaat verder met zijn opdracht om 's werelds grootste Pokémon trainer te worden, samen met zijn beste vriend Pikachu. Tijdens hun reis vinden ze het ei van Manaphy, en zijn beschermer, Pokémon Ranger Jack "Jackie" Walker. Jackie's missie is om het ei te beschermen voor de Phantom Pirate. Ash en zijn vrienden helpen hem daarbij, en proberen het ei terug te brengen naar de Sea Temple.

Na het accepteren van een uitnodiging van een mysterieuze trainer, ontmoeten Ash, Misty en Brock MEWTWO, een kunstmatig gecreëerde Pokémon die wil vechten.

Een enorme kristallen catastrofe wordt losgelaten op Greenfield — en Ash, Pikachu en hun vrienden moeten uitzoeken hoe ze de schade aan de eens zo prachtige stad ongedaan kunnen maken. Dan gebeurt er iets vreselijks: de moeder van Ash wordt ontvoerd door de machtige Entei, een Pokémon waarvan werd gedacht dat hij alleen in legenden bestond.

Diep in een afgelegen gebied van de Johto regio is een plaats met kristalhelder water, verboden bergen en een geheim. Mewtwo en andere gekloonde en superkrachtige Pokémon hebben eindelijk een huis gevonden waar ze kunnen leven en gedijen, ver weg van de nieuwsgierige ogen en harde oordelen van de mensen. In Pokémon: The First Movie, verwijderde Mewtwo alle sporen van zijn strijd met Mew, van zijn bestaan en van die van de andere klonen. Ieders geheugen werd gewist, behalve die van Giovanni's, de kwade kracht achter Mewtwo's ontstaan. De sluwe leider van Team Rocket heeft echter het idyllische toevluchtshaven van Mewtwo ontdekt en wil nog steeds Mewtwo aan zijn wil onderwerpen. Het lot wil echter dat Ash, Pikachu en hun vrienden ook het oord hebben ontdekt.

Een vreemde meteoor met een krachtig geheim stortte vier jaar geleden neer op aarde. Nu lijkt het erop dat de meteoor eindelijk zijn geheim gaat prijsgeven. Net nu Ash, Pikachu en alle andere Pokemon vrienden op weg zijn naar Larousse City. Aangekomen in deze "high tech"(TM) stad ontmoeten ze Tory, een nieuwe vriend die bang is voor Pokemon en hun trainers. Plotseling verschijnen er mysterieuze lichten boven de stad en tegelijkertijd verschijnt Deoxys, een Pokemon zoals je nog nooit hebt gezien! Dan ontstaat er een strijd tussen Deoxys en de Pokemon Rayquaza. Ash, Pikachu en hun vriendjes moeten alles op alles zetten om ze te stoppen!

Ash en zijn vrienden zijn uitgenodigd op een groot festival, waar gevierd wordt dat lang geleden held Sir Aaron en zijn Pokémon Lucario de wereld hebben gered van de ondergang door gebruik te maken van de krachten van een Magische Boom. Ash en Pikachu winnen de Pokémon wedstrijd, krijgen de titel 'Beschermer van Aura' en mogen de staf van Sir Aaron voor een avond vasthouden. De staf waarvan men denkt dat de verdwenen Pokémon Lucario er al jaren in gevangen zit. Maar de feestvreugde is snel voorbij als de mysterieuze Pokemon Mew opduikt en Pikachu meeneemt. Op datzelfde moment weet Lucario uit de staf van Sir Aaron te ontsnappen. Met hulp van Lucario gaat Ash op zoek naar de Magische Boom en de legendarische Pokémon Mew. De toekomst van de wereld hangt nu af van de hechte vriendschap tussen mensen en Pokémons.

Ash en zijn vrienden komen een lichtgeraakte en bijdehante Pokémon tegen met de naam Shaymin. Hij wil graag terug naar zijn vrienden, maar wordt daarin gestuit door een enorm gevecht tussen Giratina en Dialga. Giratina is de verdediger van de Omgekeerde Wereld, en houdt niet van indringers! Als je dan ook nog 's te maken hebt met een behulpzame wetenschapper, een gevaarlijke slechterik die de baas wil worden van Giratina en een plan om heerser van de wereld te worden, heb je het grootste Pokémon avontuur ooit! Hoe komen Ash en zijn vrienden uit deze benauwde positie? Zal de trotse en koppige Shaymin zijn vrienden weer terugzien? Je beleeft alles in Pokémon: Giratina en de Krijger van de Lucht!

Een Pokémon-wetenschapper die een nieuw Mirage-systeem heeft ontwikkeld om uitgestorven Pokémon weer tot leven te wekken. Satoshi, Haruka, Masato en Takeshi verschijnen in het Mirage Mansion voor een demonstratie van deze nieuwe machine, maar zijn getuige van de ontvoering van de wetenschapper! Dan verschijnt er een mysterieuze vreemdeling die beweert dat de machine daadwerkelijk Pokémon kan maken zonder zwakke punten. Het is aan Satoshi en zijn bedrijf om het natuurlijke evenwicht van de Pokémon-wereld te behouden.

Ash heeft al veel gezien en meegemaakt op het gebied van Pokémon, maar is hij ook klaar voor het nieuwste en geweldige avontuur van de mysterieuze Darkrai? Terwijl onze avontuurlijke vrienden op weg zijn naar een Pokémon wedstrijd, komen ze door het stadje Alamos, waar de Tijd-Ruimte-Toren staat. Samen met de mooie Alice ontdekken Ash en zijn vrienden, dat iets voor vreselijke nachtmerries zorgt bij Pokémon en mensen.

Op een mooie dag besluiten de meisjes een themapark te bezoeken genaamd 'Princess Land'. Maar de vreugde van het bezoek duurt niet lang als Coco en Natsu worden ontvoerd naar het Land van Spiegels door twee figuren die op beren lijken. De meisjes volgen hen en moeten niet alleen vechten tegen de kwaadaardige schurk Shadow, maar ook tegen hun eigen dubbelgangers.

In de stad Minato Mirai in Yokohama is het nieuws over de nederlaag van Fusion tegen de Pretty Cures het populairste onderwerp in de stad! Overal zijn meisjes verliefd op de Pretty Cures, ze verkleden zich en treden op als hun favoriete Cures. Alleen Sakagami Ayumi, de nieuwe transferstudent, is alleen. Op weg naar huis van school komt Ayumi een vreemd wezen tegen. Nadat ze het Fuu-chan hebben genoemd, worden Ayumi en het wezen al snel goede vrienden. Fuu-chan is echter eigenlijk een stukje Fusion en bezit de kracht van duisternis. In een poging Ayumi gelukkig te maken, slikt Fuu-chan alles op wat Ayumi niet leuk vindt, waardoor er chaos ontstaat op school en in de hele stad! Om Ayumi's ware gevoelens aan Fuu-chan over te brengen, werden alle 28 Pretty Cures opnieuw verzameld. Wanneer de krachten van iedereen samenkomen, begint er een wonderbaarlijk licht te schijnen.