The Maze Runner, gebaseerd op de gelijknamige bestseller van James Dashner, speelt zich af in een post-apocalyptische wereld. Nadat zijn geheugen is gewist, komt Thomas terecht in een gemeenschap van jonge mannen.

In de jaren 70 is de zwaarlijvige tiener Bobby Marks voortdurend het mikpunt van spot op school en is hij allesbehalve zelfverzekerd. Een zomerperiode markeert echter een keerpunt als Bobby een vakantiebaantje heeft bij Dr. Kahn. Gaandeweg leert de tiener om voor zichzelf op te komen.

Sekstherapeut Peter Newmans (Johnny Simmons) komt tot de vervelende ontdekking dat een goedaardige hypofysetumor zijn hormoonspiegels ernstig heeft verstoort. De tumor wordt verwijderd, maar dit heeft de consequentie dat Peter de puberteit opnieuw zal doormaken in een tijdsbestek van slechts enkele weken.