In het jaar 20XX ontvangt een jonge jongen genaamd Netto Hikari een heel bijzonder geschenk als hij naar de 5e klas gaat: zijn eigen aangepaste Net Navi, Rockman.

Aichi Sendō is een timide derdejaars middelbare scholier die zijn leven altijd achterom heeft gekeken in plaats van vooruit. Hij heeft echter een kaart genaamd 'Blaster Blade' die hem werd gegeven toen hij klein was, en dat is het enige dat hem in stand houdt. Dan laat Kai Toshiki, een koelhartige middelbare scholier, Aichi kennismaken met een kaartspel genaamd 'Vanguard'. Wanneer deelnemers strijden, stellen ze zich voor dat ze zich op een planeet bevinden die 'Klay' heet, en aangezien Vanguard een nooit eerder vertoond spelsysteem heeft, is het over de hele wereld populair geworden. Aichi vindt Vanguard meteen leuk, dus begint hij het te spelen met zijn vrienden Misaki Togura en Kamui Katsuragi, en anderen zoals zijn nieuwe rivaal Kai (die een van de beste Vanguard-spelers is). Aichi speelt elke dag en hij streeft er met heel zijn ziel en hart naar om beter te spelen, dus als hij tegen Kai vecht, zal Kai de waarde van Aichi herkennen.

Het verhaal draait om de reizen van het Bilkis-ruimteschip door het zonnestelsel en de bemanning van genetisch gemanipuleerde mensen, terwijl ze proberen de mysteries te ontrafelen van een buitenaardse technologie die de aarde dreigt te vernietigen, en waarvan de aard de ware oorsprong en bestemming kan onthullen. van de mensheid aan het einde van de 23e eeuw.

Een droom van uit de lucht vallen... en dan geboorte. Rakka wordt vanuit een grote cocon in het Oude Huis geboren, begroet door een groep vrouwtjes met kleine vleugels op hun rug en glanzende halo's boven hun hoofd. Al snel groeien Rakka's eigen vleugels, wordt er een halo op haar hoofd geplaatst en krijgt ze te horen dat ze in het nabijgelegen stadje Grie moet werken. Ze realiseert zich al snel dat de stad en de hele wereld waarin ze leven zich opsluiten achter de Muur, een hoge, ondoordringbare muur die niemand behalve de mysterieuze Toga mag verlaten.