In een vreemde bioscoop wordt iedereen meegezogen in de film waar ze naar kijken. Hoe langer ze blijven, hoe minder ze zich herinneren van de echte wereld!

2199, het buitenaardse ras de Gamilas laat het radioactieve meteorieten regenen op Aarde waardoor de oppervlakte onbewoonbaar wordt. De mensheid leeft teruggetrokken in steden diep onder de grond. Met nog een jaar te gaan voordat ook daar de radioactiviteit doordringt, ontvangen de mensen een bericht van Koningin Starsha van planeet Iscandar. Starha beweert een apparaat te hebben, de "Cosmo-Cleaner D", die de aarde kan reinigen van de gevaarlijke straling.

Een jongen genaamd Tsutomu en vier cyborghonden vechten tegen buitenaardse wezens van het insecttype van de Planet Devil.

In het jaar 2772 is de aarde en vele van zijn koloniën in verval geraakt. Een klein jongetje genaamd Godo groeit eenzaam op in een hermetisch afgesloten en technisch geavanceerde kamer. Zijn enige metgezel is de vrouwelijke robot Orga die over hem waakt. Wanneer Godo op leeftijd is wordt hij gerekruteerd en getraind in een militair kamp. Zijn baas Rock is onder de indruk van Godo’s capaciteiten en stuurt Godo eropuit om de mysterieuze Phoenix te vangen, een mythisch wezen met de kracht van wedergeboorte.

Door de ontdekking van Vizorium zijn warpmotoren in staat om supersnel door de ruimte te reizen. Deze ontdekking heeft ertoe geleid dat in 2141 er ruim 3000 onafhankelijke ruimtekolonies zijn verspreidt over het gehele sterrenstelsel. Op de planeet Agerna concurreren de kapitalistische staat Edia en de totalitaire staat Uldas met elkaar om de grote voorraden Vizorium. Als het complex van Uldas vernietigd wordt, worden de geheim agenten Kei en Yuri naar de planeet gestuurd om te uit te vinden wat er heeft plaatsgevonden. Hierbij komen ze de charmante doch geslepen smokkelaar Carson B. Carson tegen.

Wanneer een onderzoeksploeg in de ruimte het verlaten schip 'Green Planet' ontdekt dat hun gebied binnendringt, ontmoeten ze Buzz, de commandant en enige overlevende van het schip. Omdat hij geen informatie heeft over zijn schip, zal het onderzoeksteam al snel ontdekken dat ze iets veel, veel ergers hebben gevonden...

Het Galman Rijk werd vernietigd, maar de planeet Galmania nog niet, door een toevallige botsing van sterrenstelsels. De Bolar Federatie werelden waaronder Planet Bolar worden hierdoor vernietigd. De Yamato, terug onder het commando van Captain Okita, ontmoet de planeet Denguil te laat om zijn humanoïde beschaving te redden van overspoeling door de water planeet Waterman. De overlevende Denguili, een krijger ras die geloven dat alleen de sterken moeten overleven, zijn van plan om Aquarius te gebruiken om de Aarde te overspoelen en de mensheid te vernietigen, om zo een nieuwe thuis te creëren voor hun ras.

Joe en zijn groep huurlingen (onderdeel van de organisatie Crushers), raken door een uit de hand gelopen missie hun licentie als 'Crusher' kwijt. Om hun naam te zuiveren infiltreren zij in de organisatie van de 'Pirates', wat ook een huurlingen-organisatie is. Tijdens hun onderzoek komen ze achter een grootschalig complot, dat al het leven in het heelal bedreigt.

Deze pilot, de eerste geanimeerde bewerking van de populaire mangaserie, introduceert de hoofdpersonen van 'Lupin the Third' met montages, gepresenteerd in een kort kaderverhaal dat een typische ontsnapping van een bende illustreert.

Een bloedige burgeroorlog is het decor voor Lupin's nieuwste capriolen; de leider van een van de facties heeft documenten in handen die zijn geschreven door Earnest Hemingway en bevatten de locatie van een opmerkelijke schat. Terwijl Goemon en Jigen aan weerszijden van de oorlog vechten, moet Lupin deze uitdaging alleen aangaan. Kan Lupin, terwijl de oorlog voortduurt, de schat veiligstellen en voorkomen dat Goemon en Jigen elkaar vermoorden?!