Drie jaar lang vinden er in de stad Shingoku vreemde moorden plaats waarbij alle lichaamsvloeistoffen van de slachtoffers worden afgevoerd. Bij elk incident is er altijd minstens één overlevende. De persoon die verantwoordelijk is voor deze moorden zou een zekere 'Kappa' zijn...

Sharaku Homonji is de oudste zoon van een vooraanstaande familie die al generaties lang misdaad bestudeert. De oudste zoon uit de Homonji-familie heeft al generaties lang een IQ van 246 getest en Sharaku Homonji heeft een IQ van 246. Soko Wato is een detective. Op een dag wordt ze toegewezen aan onderzoekssectie #1. Haar taak daar is niet het onderzoeken van misdaden, maar het begeleiden van Sharaku

Izumi Sakuragi is een nieuwe politie-sergeant bij het Special Investigations Office, dat in november vorig jaar werd opgericht binnen de Metropolitan Police. Het nieuwe onderzoeksteam maakt gebruik van DNA-analyse en de nieuwste forensische wetenschap om cold cases te onderzoeken, evenals zaken van vermiste personen.

In een rechtssysteem dat vrijwel iedere verdachte aanklaagt, doet een advocaat er alles aan om zijn of haar cliënt te verdedigen – hoe duidelijk het bewijs tegen hem of haar ook is.

Ritsu Hayakawa, een student, leeft in geluk samen met zijn lieve familie; jongere broer, jongere zus en moeder, Kyoko. Hun glimlach en mama's rijst omelet maken hem altijd blij. Kyoko moet echter in het ziekenhuis worden opgenomen voor kanker. Hij gaat met een somber gevoel terug naar huis en ziet dat zijn broers en zussen, die niets weten van de ziekte van hun moeder, enthousiast zijn over een pizza-to-go voor het avondeten. Ritsu kan er niet tegen om ze te zien, dus rent hij weg naar de keuken, waar hij een notitieboekje vindt waarin zijn moeder haar recept heeft opgeschreven. Hij merkt hoeveel Kyoko van haar familie houdt en hoe belangrijk maaltijden zijn, dan besluit hij een maaltijd voor hen te bereiden om het leven van zijn gezin in stand te houden. Op een dag komt Ritsu erachter dat hij geen bloedverwant is aan Kyoko. Hij is een geadopteerd kind. Ritsu gaat naar zijn biologische moeder, Maya, en dan ziet hij dat Maya zijn biologische broer, Ruka, wreed behandelt.....

Het verhaal speelt zich af in de nabije toekomst van Japan, waar seksuele activiteit bij wet verboden is. Inuda Hikaru is een erestudent wiens vader leidinggevende is bij Setori (controlebureau voor seksueel wangedrag van het ministerie van Volksgezondheid, Arbeid en Welzijn). Hikaru streeft ernaar om net als zijn vader te worden en vindt seks onaangenaam. Minase Yu is Hikaru's jeugdvriendin die een scherpe tong heeft maar uitblinkt in haar cijfers. Yu is ook een grote fan van de nationaal bekende actrice Uchu Misora, beter bekend als Uchura. Op een dag wordt Hikaru door een klasgenoot uitgenodigd in een duistere club die alleen toegankelijk is voor leden, waar hij getuige is van mannen en vrouwen die zich bezighouden met illegale seksuele handelingen. Hij is ook verrast om Uchura, die beweert 'puur' te zijn, daar te zien met een man. Voordat hij het beseft, wordt Hikaru betrapt in een 'onderwereldorganisatie' waar seksuele activiteiten plaatsvinden.