Het dodelijke Medusavirus, dat zijn slachtoffers versteent, overspoelt de hele wereld. De autoriteiten slagen er niet in om een remedie te vinden en besluiten een aantal mensen in vriesslaap te brengen in afwachting van een geneesmiddel. De jonge Kasumi is een van de 160 uitverkorenen. Ze wordt naar het Cold Sleep Capsule Center gebracht, een reusachtige crypte binnenin een oud kasteel. Kasumi hoopt dat ze bij het ontwaken haar tweelingzus Shizuku zal kunnen terugzien, ook al werd deze aangetast door het Medusa virus. Wanneer Kasumi en de anderen wakker worden, merken ze dat hun omgeving drastisch is veranderd.