Autómata speelt zich af in de toekomst met de wereld op de rand van een ecologische ineenstorting. De wetenschap staat op het punt om haar droom te realiseren met het creëren van kunstmatige intelligentie. Jacq Vaucan, een veiligheidsagent van ROC Robotics Corporation, onderzoekt routinematig een zaak over het manipuleren van een robot.

Cade Yeager wordt beschermd door Autobots Bumblebee, Hound, Drift, en Crosshairs. Optimus Prime wordt nog steeds vermist, hij is namelijk alle uithoeken van het universum aan het afzoeken naar zijn schepper Unicron.

Een seriemoordenaar houdt een stad in zijn greep en Latijnse inscripties, geschreven met het bloed van de slachtoffers, worden op muren teruggevonden. De misdaden worden door velen toegeschreven aan de “Golem” uit een Joodse legende. De inspecteur Kildaire wordt op de zaak gezet en hij woont het proces tegen de artieste Elizabeth Cree bij.

Er doet zich een kans voor voor Robert Atkinson, een Londense bankier die het geld van zijn bank riskeert om het alledaagse achter zich te laten en een nieuw leven te beginnen. Om hiervan te profiteren, meldt hij zich onbewust aan bij een Chinees kartel om een koffertje naar Amsterdam te vervoeren. Maar alles is niet wat het lijkt in een stad die wordt gesluierd door duistere geheimen. Gevoed door machtsspelers, drugs, verleiding en geweld, wacht Robert op zijn beurt in een dodelijk spel van keuze en gevolg.